神秘飞翔体“灾”突然降临，凭借压倒性战力凌驾于所有航空力量之上。人类为对抗这一灾厄，开发出经过特别调整、拥有超高机动力的兵器“子体”，而操控它们的竟是外表如少女般的机构“阿尼玛”。失去驾驶员母亲的少年鸣谷慧，便是在这样的背景下，邂逅了闪耀鲜红光辉的瑞典制战机及其驾驶者格里芬。
这部作品在视听体验上呈现出极端的割裂感。一方面，空战画面的动态表现堪称优质，战机穿梭的光影效果令人眼前一亮；另一方面，日常文戏的作画质量却时常崩坏，甚至被观众吐槽为“光污染”和“没法看”。这种经费分配的不均，让追求完美画风的观众感到煎熬，却让更看重空战爽感的受众找到了乐趣。
剧情设定虽不乏亮点，如将超机动战机与实体化少女结合的创意，以及融入其中的中国元素，但叙事节奏和结局处理却备受争议。有人批评其剧情逻辑混乱、收尾尴尬，甚至沦为俗套的后宫烂尾剧；也有观众认为角色性格塑造尚可，舒适的叙事节奏弥补了人设的平庸。特别是主角与中国青梅竹马仅在结尾突兀飙出方言的细节，更让部分观众感到莫名其妙。
总体而言，《飞翔吧！战机少女》是一部优缺点都极其鲜明的作品。它用精彩的空战弥补了作画的粗糙，又因糟糕的剧本结构劝退了不少期待严谨故事的观众。若你只愿享受机械少女在空中交织的炽热火花，或许能从中获得片刻满足；但若对剧情逻辑和画面稳定性有较高要求，这番恐怕只会留下一地鸡毛。
