绫波丽走向红色水池的瞬间，命运似乎已注定终结，而碇真嗣与明日香正被卷入一场关于人类存亡的疯狂博弈。葛城美里拼命守护着少年少女，赤木律子则带着对碇元度的憎恨引爆了超级电脑 MAGI，SEELE 与 NERV 高层的算计在“人类补完计划”中彻底失控。这不仅是机甲与使徒的厮杀，更是一场直指灵魂深处的哲学风暴。
画面在这里变得极度狂乱而露骨，明日香在回忆母亲的温暖中单挑九台量产机，却被洁白双翼的怪物分尸，巴赫神圣的咏叹调伴着血肉横飞显得无比讽刺。初号机化作生命之树刺入莉莉丝之眼，全人类在生理性的高潮中化为红色光点汇聚于黑之月，性隐喻与暴力奇观交织成一场心理层面的集体狂欢。这种近乎病态的视觉冲击，赤裸裸地撕开了个体渴望融合又恐惧消失的矛盾伤口。
有人批评这种充满性意识与黑暗面的结局与 TV 版割裂严重，像是在平房地基上强建高楼，但不可否认它带来的震撼足以改写动画史的认知。真嗣最终在沙滩醒来，面对拒绝自己的明日香，那记未落下的掐脖手势道尽了生存的荒谬：人为了逃避孤独渴望融为一体，却又必须借由他人的刺痛来确认自我的存在。
这部作品用最极端的意象告诉我们，活着就是一场自作孽的操蛋旅程，即便遍体鳞伤，我们也只能在那无法完全理解的隔阂中，笨拙地寻找继续呼吸的理由。
